Harry, Marge Hala ailesi hakkında küçümseyici bir şekilde konuşunca çok sinirlenir. Onu balon gibi şişirir. Ve evden kaçarak esrarengiz bir şekilde geceyarısı otobüsüyle büyücüler için bir dinlenme yeri olan Çatlak Kazan’a gider. Bu arada, Sirius Black’in Azkaban’dan kaçtığını öğrenir. Bir süre sonra arkadaşları Hermione ve Weasley’ler de ona katılır. Harry, Mr.ve Mrs.Weasley’nin Sirius Black’in onu ölü istediğini söylediklerine kulak misafiri olur. Okula dönerken Harry ve arkadaşları trende yeni Karanlık Sanatlara Karşı Savunma öğretmeni olan Profesör Lupin ile tanışırlar. Tren aniden durur,ışıklar söner ve kapıda bir Ruh Emici belirir. Harry çığlıklar duyar ve bayılır. Çocuklar Hogwarts’da, Ruh Emiciler'in okulu Sirius Black’den koruduğunu öğreniler. Hagrid’in sınıfında Draco Malfoy, Şahgaga adındaki bir hipogrif tarafından tırmalanır. Lupin’in sınıfında ise öğrenciler Böcürt'e karşı büyü yapmayı öğrenirler.

Hermione’nin kedisi Crookshanks Ron’un faresi Scabbers'i kovalayınca iki arkadaş arasında sürtüşmeye neden olur. Harry,diğer üçüncü sınıf öğrencileri Hogsmeade’e gidince kendini terkedilmiş gibi hisseder. Gryffindor kule girişindeki Şişman Kadın portresi yırtılmış ve portreden yok edilmiştir. Herkes Sirius Black nedeniyle alarm durumundadır. Hufflepuff’a karşı yapılan Quidditch maçında Harry Ruh Emicileri tekrar görür ve yine bayılır.Nimbus süpürgesi zarar görür.Bu arada Lupin Harry’ye Ruh Emici'lere karşı koyması için yardım etmeye söz verir. Fred ve George Weasley kardeşler Harry’ye Hogwarts’dan Hogsmeade’ye nasıl gideceğini gösteren Çapulcular Haritası'nı verirler. Harry,orada alışveriş yapan Ron ve Hermione’ye katılır. Üç Süpürge’de Harry, Sirius Black’in ailesinin dostu ve Sır-saklayıcısı olduğunu, onlara ihanet ettiğini ve aynı zamanda diğer dostları Peter Pettigrew’u da öğrenir. Harry, yeniyılda kimden geldiği belli olmayan bir Ateşoku kazanır. Ravenclaw’a karşı oynadıkları Quidditch maçında Harry Draco Malfoy ve arkadaşlarına dönüşen bazı Ruh Emici'leri kovmak için Patronus büyüsünü kullanır. Ron bir gece Sirius Blake yatakhaneye girince bağırarak uyanır. Harry tekrar Hogsmeade’ye gider.Fakat bu kez Draco onu görür. Snape Harry’yi yakalar ve Çapulcular Haritası'nı alır.

Şahgaga idama mahkum edilir. Harry ve Gryffindor’lu arkadaşları Quidditch kupasını kazanırlar. Profesör Trelawney Voldemort’un uşağının yakında ona katılacağını söyler. Ron kayıp faresi Scrabbers'i Hagrid’in süt şişesinde bulur. Gerçek sonunda ortaya çıkar; Sirius Black, Harry’nin ailesine ihanet etmemiştir. Remus J.Lupin, bir kurt adamdır ve Profesör Snape ona dolunayda değişmemesi için iksir vermektedir. Harry, Sirius Black ve Remus J.Lupin’in Peter Pettigrew’u öldürmelerini engeller. Çünkü babasının onların katil olmasını istemeyeceğini düşünmektedir. Her nasılsa, Peter Pettigrew serbest kalır ve Ruh Emiciler Sirius Black’i yakalar. Harry Patronus büyüsünü kullanarak Black’i kurtarır.Harry ve Hermione zaman makinesini kullanıp Şahgaga’yı idamdan kurtarırlar. Şahgaga, Black’i güvenli bir yere götürür. Dumbledore da Harry’ye babasının onun içinde yaşadığını söyler.